簡易解説　
「不老手術を受けた者同士で子供を作ることができない」という事実を知らなかったから

解説

「使徒」たちがタイムスリップする前の世界での話。

はじめは「不老手術を受けた者同士で子供を作ることができない」という事実は全く分からなかった。
治験段階で不老手術を受けた人は皆まったく副作用がなく、普通の生活ができると判断されたからだ。
そのため、不老になれば人類が繫栄していくと願った政府が、成人すれば国民に不老手術を受けさせた。国民も、人類が滅亡しそうな状況に一矢報いられる、そして敵国でも行われている不老手術に負けてはならない、と、皆不老手術を受けた。

それから数年がたち、初めて「不老手術を受けた者同士で子供を作ることができない」という事実が確認された。
（その理由は不明だが、不老ならば子孫を残す必要はなく、故に子供を残す必要がないから、というのが通説とされている。）

そこには子孫を残すことが出来ない人々しか残っておらず、不老とはいえ事故や天災などは命を落としうるので、人類はさらに数を減らしていった。